Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLOCKO15516 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms