Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms