Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms