Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PMD0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PMD0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PMD0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PMD0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PMD0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PMD0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PMD0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PMD0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PMD0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms