Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms