Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLL13PA6NNM8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms