Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms