Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB12Q9Y5F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms