Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms