Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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SH3BP1Q9Y3L3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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SH3BP1Q9Y3L3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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