Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHTF1Q9UMS5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms