Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms