Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms