Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPC1L1Q9UHC9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms