Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms