Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms