Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB4Q9UDY4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms