Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA2D2Q9NY47 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms