Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR4AQ9NXH8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms