Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJC28Q9NX36 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms