Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms