Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms