Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTIF3Q9H2K0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms