Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZYG11BQ9C0D3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms