Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF4Q9BZC1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF4Q9BZC1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF4Q9BZC1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF4Q9BZC1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF4Q9BZC1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF4Q9BZC1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF4Q9BZC1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms