Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms