Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIKE1Q9BRV8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms