Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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