Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3AQ99856 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms