Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD4Q96M96 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms