Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM47Q96LD4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms