Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms