Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms