Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms