Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFKQ969G6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms