Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCC1Q92922 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCC1Q92922 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms