Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX54Q8TDD1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms