Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms