Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT2Q8N9I0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms