Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF1Q8N6C5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms