Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC24Q8N4L8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC24Q8N4L8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms