Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC6Q7Z403 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms