Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L3Q6VB84 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms