Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO38Q6PIJ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms