Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40BQ6NWY9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms