Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms