Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms