Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LRRC8EQ6NSJ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms