Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms