Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf60Q5U649 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms